Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tchhl1Q9D3P1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tchhl1Q9D3P1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms