Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed11Q9D2R4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed11Q9D2R4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms