Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D2Q3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D2Q3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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