Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt44Q9D2Q2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trmt44Q9D2Q2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trmt44Q9D2Q2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms