Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec13Q9D1M0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sec13Q9D1M0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms