Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap57Q9D180 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap57Q9D180 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap57Q9D180 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap57Q9D180 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms