Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hddc3Q9D114 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hddc3Q9D114 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms