Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arv1Q9D0U9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arv1Q9D0U9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms