Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gtf2e1Q9D0D5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms