Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ribc1Q9D0B8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ribc1Q9D0B8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms