Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mms19Q9D071 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Mms19Q9D071 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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Mms19Q9D071 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mms19Q9D071 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mms19Q9D071 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms