Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp3Q9CZX0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Elp3Q9CZX0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp3Q9CZX0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms