Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab3bQ9CZT8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rab3bQ9CZT8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab3bQ9CZT8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms