Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ15

Gins1, DNA replication complex GINS protein PSF1, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins1Q9CZ15 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins1Q9CZ15 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gins1Q9CZ15 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms