Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssu72Q9CY97 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssu72Q9CY97 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ssu72Q9CY97 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms