Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl11Q9CXW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms