Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgo1Q9CXH7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgo1Q9CXH7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgo1Q9CXH7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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