Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Malsu1Q9CWV0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms