Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tdrd12Q9CWU0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tdrd12Q9CWU0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms