Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NubplQ9CWD8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms