Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sppl3Q9CUS9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sppl3Q9CUS9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms