Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smurf1Q9CUN6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smurf1Q9CUN6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smurf1Q9CUN6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms