Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930553M12RikQ9CUH1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930553M12RikQ9CUH1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms