Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smc1aQ9CU62 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smc1aQ9CU62 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smc1aQ9CU62 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms