Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snw1Q9CSN1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snw1Q9CSN1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snw1Q9CSN1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms