Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr3kQ9CQZ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms