Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms