Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ykt6Q9CQW1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms