Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2Q9CQP2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2Q9CQP2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms