Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccer1Q9CQL2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccer1Q9CQL2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms