Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rwdd1Q9CQK7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rwdd1Q9CQK7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms