Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms