Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQ90 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQ90 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQ90 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CQ90 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CQ90 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CQ90 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CQ90 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms