Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm22Q9CQ85 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Timm22Q9CQ85 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Timm22Q9CQ85 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Timm22Q9CQ85 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms