Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp2Q9CQ73 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp2Q9CQ73 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms