Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rnaseh2cQ9CQ18 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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