Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chmp3Q9CQ10 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp3Q9CQ10 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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