Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc198Q9CPZ1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms