Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW4

Arpc5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5Q9CPW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arpc5Q9CPW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arpc5Q9CPW4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms