Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpl17Q9CPR4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl17Q9CPR4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpl17Q9CPR4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms