Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cox6cQ9CPQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cox6cQ9CPQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cox6cQ9CPQ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cox6cQ9CPQ1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cox6cQ9CPQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox6cQ9CPQ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox6cQ9CPQ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox6cQ9CPQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox6cQ9CPQ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox6cQ9CPQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox6cQ9CPQ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cox6cQ9CPQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms