Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcg5Q99PE8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcg5Q99PE8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Abcg5Q99PE8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Abcg5Q99PE8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcg5Q99PE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcg5Q99PE8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms