Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cep41Q99NF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cep41Q99NF3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms