Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl3Q99N95 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl3Q99N95 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms