Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6cQ99N08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms