Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4dQ99N05 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a4dQ99N05 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ms4a4dQ99N05 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.7 ms