Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BrapQ99MP8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrapQ99MP8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms