Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms