Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd3Q99LY2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd3Q99LY2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms