Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clp1Q99LI9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clp1Q99LI9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clp1Q99LI9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms